植物浸制標本在固定和保存過程中，會出現的變色、退色、變形、霉變等現象，均為程度不同的質變。主要有以下幾種情況：①化學質變。由化學反應引起的質變。如類胡蘿卜素是廣泛分布于植物體的色素，它們易與空氣中的氧作用，發生自動氧化反應而引起退色，其中脂肪的破壞，是由于脂肪受熱或金屬催化劑的活化后，分解成不穩定的游離基，再與氧生成過氧化物游離基，進而生成氫過氧化物而分解。②生化質變。標本如果固定不充分、不及時，就不可能迅速殺死細胞，細胞就會發生死亡后變化，導致細胞膨脹、解體。酶促褐變是引起標本變色的原因，它是由酚酶催化酚類物質，形成醌及其聚合物而造成的。甲酚酶可使植物體中的酪氨酸生成多巴，進而生成多巴色素。多巴色素經聚合作用成為黑色色素。③生物質變。微生物遇到適宜的環境條件，會害各種生物材料，通過酶的作用引起被侵害物的生物降解。同時，微生物還靠本身的著色作用，引起標本變色。④光化學質變色素分子吸收可見光后，形成電子激發態，被激發的色素分子參與光氧化反應造成色素的裂解。